附睪囊腫手術僅單純將囊腫剝離、取出，故創傷相對較少，但止血短期內如止血不嚴密，手術部位會出現血腫或水腫，此為常見情況。 水腫表現為手術部位鼓脹，手捏有疼痛感，通常3-6個月后逐漸消失。另一種情況為術后6-12個月后可能感覺手術部位稍有不適，此種情況較難說明原因，但囊腫切除為小手術，相對較簡單，理應不會有太大的并發癥或后遺癥出現。