多囊卵巢綜合征是一種功能性失調或紊亂性疾病，在臨床治療中相對困難，較為棘手。因本病發病原因暫不明確，可能與遺傳相關，故在治療上以對癥治療為主，比如出現月經異常、不孕時，應使用藥物調理月經，甚至需借助試管嬰兒等輔助生育技術，幫助患者完成生育愿望；有肥胖、胰島素抵抗等癥狀時，還應進行飲食控制、運動等改善相應癥狀。此外，本病需花費更長時間來治療和管理。