腺垂體功能減退，涉及三個系統的軸的功能減退。臨床應使用相關激素給予替代治療。從甲狀腺軸來說，應給予甲狀腺激素來替代；從腎上腺皮質激素來說，應給予糖皮質激素、鹽皮質激素來替代；從性激素軸來說，應給予性激素的替代。甲狀腺軸的替代要注意一點，必須先把腎上腺皮質軸的激素藥替代在前。如果先用甲狀腺激素，再用腎上腺皮質激素，可能誘發腎上腺皮質危象。這兩種激素可以同時用，但是必須是腎上腺皮質激素先用。性激素替代，對于有生殖要求或者月經要求的女性病人，可以給予人工周期；對男性病人來說，可以給予雄性激素替代。如果有生育要求，還可以用一些促性腺激素的替代治療，再定期到醫院復查，根據化驗結果調整藥物用量，把激素調到正常水平，使患者能夠正常生活。