巨腦回畸形的嚴重程度，與畸形部位、畸形范圍等相關。腦回的多少、腦回和腦溝的深度，可能與智力成正比關系。嚴重時，可導致雙側巨腦回畸形，甚至無腦回畸形，而導致較嚴重后果，可能發生各種功能障礙，產生癡呆、癲癇發作等表現，成為殘疾兒。但如果僅局限于一個腦溝或腦回，可能僅表現為癲癇發作，平常均屬正常表現。故若影響范圍較小，危害相對較輕。