血液灌流常見并發癥是凝血功能異常，因為這類病人做血液灌流要接受大劑量的常規肝素抗凝治療，所以用肝素之后，很多病人可能會出現凝血功能異常，病人可能出現出血傾向。還有一類病人接受血液灌流之后，體內血小板可能會被破壞，血小板破壞后，病人也可能容易出現出血，這是常見的副作用。還有少數病人對血液灌流器、透析器可能會有過敏反應。有些病人做血液灌流，可能會表現為頭暈、惡心、嘔吐，甚至出現低血壓、心率快，但這些相對不是特別多，主要需關注病人的凝血功能。如果病人有凝血功能異常，一般做血液灌流相對要比較慎重。