做活檢后肚子疼的原因很多，常見有以下幾種：1、比較常見的活檢是胃鏡、腸鏡，肚子痛的原因可能是充氣所導致，本身做活檢時，要在胃鏡或者腸鏡中，充入很多氣體，而做完活檢后沒有及時回抽，患者肚子，以及胃、腸等出現痙攣，便會引起肚子疼；2、活檢時夾的位置較深、出血較多，甚至將胃壁或腸壁夾穿，此時要及時到急診科就診，通過拍片等檢查，確認是否有穿孔；3、對于部分比較敏感的患者，通過胃腸鏡取活檢后，輕微疼痛也會被感覺到；4、對于穿刺的活檢，比如B超引導下的腹腔腫塊穿刺、肝臟穿刺、脾臟穿刺、腎臟穿刺等，本身穿刺的針道會引起局部的肚子疼痛。其他還包括穿刺位置過深，或穿孔后腹腔內出血等，均可引起肚子疼。綜上所述，一旦出現肚子疼的情況，或短時間沒有恢復，大部分患者的肚子疼是一過性，即10-20分鐘、30分鐘或60分鐘便可好轉。如果疼痛時間較長，或肚子疼逐漸嚴重，則應到醫院及時就診，避免耽誤病情。