有一部分病人如果治療療效較好，又沒有特別明顯的排異問題，可以停藥。對于危險度比較高的病人，即使移植以后，也依然不能夠完全解決問題的病人，有可能會在移植以后，還要繼續做靶向藥的維持治療。選取的供者并不能達到全相合，此種情況排異的問題如果比較突出，有可能病人需要服用抗排異藥時間較長。所以如果是可行，能夠在選擇供者時，能盡可能去選擇全合的親屬的供者。但是真實世界當中，較難找到全相合家屬這樣的供者，較多時候要從骨髓庫或做半相合的骨髓移植，這樣排異的問題會造成病人出現排異反應，持續時間比較長，抗排異藥服用的時間也會比較長。對于較高危的病人，移植以后仍然擔心復發可能性比較大時，也會在移植以后進行靶向藥的治療，此種情況至少要服用靶向藥維持治療2年，觀察整體情況判斷是否可以停藥。