甲狀腺瘤的手術費用根據腫瘤性質的不同，包括良性腫瘤、惡性腫瘤，手術方式以及所用器械和檢查方式不同，手術費用的區別較大。良性甲狀腺腫瘤費用相對較低，因為所用的器械，包括診斷及術后的病理較為簡單。但是對于惡性腫瘤，部分患者需要清掃，甚至需胸骨劈開，這種惡性腫瘤手術程度相對較大，而且使用的器械較多，包括神經探測儀和超聲刀，甚至包括術后的病理診斷。病理診斷包含很多項免疫組化，均會大幅度增加手術費用。另外手術費用根據不同級別的醫院亦有不同，比如縣級醫院和市級醫院收費標準，以及省級醫院收費標準都會不同。醫生在為患者完成手術的前提下，會盡可能的節約費用，現在醫院有專門的甲狀腺臨床路徑，參照國家以及本院臨床路徑的選擇，也是為廣大患者盡可能節約費用的方法。