兒童補牙最大的禁忌在于不像成人補牙，和醫生不能形成很好的配合，如果不能跟醫生形成很好的配合，就可以被視為是兒童補牙的一個禁忌。 原因很簡單，在進行任何治療操作的時候，常用高速切割的器具就像高速手機，口腔需要進行隔濕，隔濕治療時候通常會使用棉花和棉紗進行隔濕處理，這些體積都比較小， 另外做根管治療的時候，使用很多根管治療的小器械，如果患兒在治療過程中出現亂動、不能配合的情況下，很容易出現高速器械誤傷，小器械包括隔濕的棉球的誤吸、勿咽，如果吸入氣道會引起比較嚴重的后果。 所以兒童如果不能跟醫生建立很好的合作情況下，會被為視為補牙的禁忌。