輸尿管反流的主要手術方式是輸尿管膀胱再植，又稱輸尿管膀胱再吻合，總體來說安全、有效。隨著技術的升高，整體成功率95%以上。可以選擇開放性手術和腹腔鏡手術，兩種手術方式又包括膀胱內和膀胱外。手術方式不同，但是最終處理原則是保證膀胱黏膜下輸尿管長度與輸尿管直徑達到5:1，可以達到抗反流的目的。手術后最常見的并發癥是反流未能消除，還有輸尿管和膀胱連接部梗阻，可能是輸尿管血運供應破壞，還有輸尿管穿過膀胱壁段時出現扭曲、成角，導致梗阻。膀胱輸尿管反流手術以腹腔鏡為主，特別是有手術條件的，因為腹腔鏡手術相對開放手術來說，創傷小、恢復快、手術風險要低。