動脈血管瘤手術后后遺癥發生率很低，大約在1%或更少。這些后遺癥包括手術后出血、滲血，如果是在心臟手術，靠近心臟的胸主動脈瘤，可能會造成心臟功能不全。如果病人采取全麻麻醉，并且又合并其他疾病，可能會造成呼吸功能不全，不能夠脫離呼吸機，脫離呼吸機之后，患者可能有呼吸衰竭。如果病變嚴重，造成脊髓缺血，可能會造成癱瘓，脊髓截癱。還有一種情況，如果病人腦部供血不足，會出現腦水腫、神經功能障礙，腦水腫患者昏迷，這種情況發生率還是很低的。如果病人不手術，可能有生命危險，但是手術不是萬能的。個別情況下會出現一些并發癥和后遺癥。有些情況經過醫生的積極的工作，可能會逆轉。