理論上講毛細支氣管炎為自限性疾病，即治療與否7-10天均可轉歸，但其可合并較多其他并發癥，如高熱、咳嗽、精神不佳。由于氣道狹窄，醫生需給予相應輔助治療，但對此病毒無特效藥物。輔助用藥同等重要，如霧化吸入，因為毛細支氣管炎因嬰兒患病而得名，應給予霧化吸入。如果胃口不佳，應給予加強營養，吸入治療協助排痰。如果缺氧嚴重，應給予吸氧。個別較嚴重者，會引起繼發細菌感染，因為嬰兒氣道本身狹窄，患病后更加狹窄，所以容易繼發細菌感染，合并細菌感染時需用抗菌素治療。綜上，毛細支氣管炎不治療自愈者較少。