所有的顱咽管瘤都是良性的。但是從形態來說，顱咽管瘤主要分三類，第一部分是由腫瘤細胞構成的實性腫瘤。第二部分是，腫瘤的一部分是實質性的腫瘤細胞構成，另部分是囊性的，是囊液。第三部分腫瘤是由實質性的、囊性的以及部分鈣化的腫瘤構成，所以腫瘤成分多種多樣。但是所有的顱咽管瘤都是良性。所以顱咽管瘤有囊性的、實質性的，還有鈣化的。腫瘤的性質不一樣，對周圍組織的影響也不一樣。比如囊性的顱咽管瘤，雖然腫瘤很大，但是它對周圍組織的影響可能會小一些，包括壓迫視神經。實質性的腫瘤壓迫視神經會比囊性的腫瘤壓迫視神經引起的癥狀要重。換句話說，囊性的顱咽管瘤對周圍組織的壓迫作用小。