提到松果體細胞瘤鈣化，就要談到它的病理來源，因為松果體細胞瘤來源于松果體實質細胞，這個區域的松果腺非常容易發生鈣化，在松果體區一些腫瘤的鑒別診斷上也容易發生，比如畸胎瘤、生殖細胞瘤、少枝膠質細胞瘤、室管膜瘤，甚至有一些鈣化的蛛網膜囊腫，在鑒別診斷中也可以出現松果體細胞瘤一樣的鈣化。所以在鈣化這個方面，作為松果體腫瘤，不是說有鈣化就一定是松果體腫瘤，但是松果體腫瘤作為影像學方面，有鈣化作為預后判斷是非常有價值的。如果是松果體細胞瘤發生鈣化，這一類腫瘤往往生長比較緩慢，它的預后也比較好，雖然它對放療不敏感，但是它生長比較緩慢，我們把這一類松果體細胞瘤一般都判斷為良性腫瘤。松果體細胞瘤也有一部分是不鈣化的，所以不是說所有的松果體細胞瘤都會鈣化，如果發現松果體細胞瘤不鈣化了，往往容易發生種植，甚至轉移，甚至出現一些其它部位的松果體細胞瘤的播散，所以并不是說鈣化是壞事情，而是提示預后比較良好的一個表現。