化療藥物具有細胞毒性，會對身體有不同程度的影響。最主要的是出現骨髓抑制，白細胞下降，三系下降，可能會造成患者并發一些感染。血色素下降，可能會引起貧血，血小板下降，患者的皮膚上可能會出現一些瘀斑和瘀點。另外，由于化療藥物通過肝臟代謝，腎臟排泄到體外，因此，化療對肝腎功能也會有不同程度的影響。化療之前醫生會告知患者，不要因為化療會對肝腎功能造成影響，而加重心理負擔。攜帶乙肝病毒的患者，在化療過程中尤其應注意監測他的乙肝病毒是否復制，如果患者在化療過程中出現了肝功能的異常，應考慮可能出現了乙肝DNA的復制，病毒的復制，這個時候需要進行抗病毒的處理。此外，白細胞下降以后，會并發一些感染，比如咽部的感染，肺部的感染，泌尿系統的感染等等。