小兒食管閉鎖手術的麻醉方式一般是全身麻醉加氣管插管。一般首先是全麻的誘導，通常用鎮靜藥、鎮痛肌藥、肌松藥進行。鎮靜藥主要一般是力月西、丙泊酚等，鎮痛藥包括芬太尼、舒芬太尼、瑞芬太尼等，肌松藥一般是順式阿曲庫銨、維庫溴銨、羅庫溴銨等。使用鎮靜藥、鎮痛藥、肌松藥以后孩子沒有呼吸，從口腔置入一個氣管導管，一直插到聲門下，連接麻醉機，以術中供氧、做呼吸，保持患兒正常的呼吸狀態。兒童的手術一般采用一些相對起效快、代謝快、術中影響比較小的麻醉藥，這樣術后孩子的舒適度也會比較好。