浮針療法的副作用主要注意傷口不要感染。特別在出汗的時候，天熱的時候，傷口感染容易造成病人不必要的痛苦。其次就是浮針操作中，有時候碰到小血管，會有皮下瘀血，如果出血比較少，隆起，用手壓一壓馬上就能夠止住，過兩天會出現皮下瘀紫，可慢慢自己吸收。一般很少見到大血管，因本身皮下大血管不多見，就是很淺的地方，一般不會出現什么風險。浮針在臨床上治療最多就是痛證，病人急性疼痛，包括急性腰痛、急性腕球肘扭傷、外傷、腰椎急性扭傷、踝關節扭傷這些，發作時間在三天之內，療效都很見效。