血液濾過是一種體外的循環，與體外循環有關的一些并發癥，比如說可能會出現空氣栓塞，一般這時可能有緊急停泵，不回血；第二個是可能會出現較大的跨膜壓，出現破膜，這時也不能回血；第三，因是體外循環，需要使用肝素，所以可能會導致肝素過量，或者是對肝素的敏感性增加，患者的出血風險就會增加，這時可能會導致，比如說病人的消化道出血或者其他的出血。如果有這種的病人，我們可能會改用體外循環方法或者使用枸櫞酸鉀抗凝，如果出現無法逆轉的出血，可能需要停止血液濾過；還有就是與我們體內的循環的不穩定狀態有關，比如出現低血壓，有些病人低血壓可能通過減少超濾、減少濾過，他的血壓可能很快上來，有些病人可能會出現高血壓，比如可能是尿毒癥腦病或其他因素導致的高血壓，可以用藥物控制血壓，有些病人可能在這個時候出現一些煩躁，可能是透析失衡導致，這時可以通過減少超濾量，或者減慢它的速度來減少透析失衡的發生。