接種HPV疫苗后不能說完全不得子宮頸癌，因為HPV疫苗不包括全部可以導致子宮頸癌的高危型HPV。 目前在我國上市的二價疫苗、四價疫苗和九價疫苗，都含有主要針對可以引起子宮頸癌的兩個高危型HPV病毒，即HPV病毒16和18型。在全球大約有70%的子宮頸癌由這兩個型別引起，還有大概30%的子宮頸癌由其他型別HPV病毒感染引起。 四價疫苗還包括引起濕疣主要的兩個低危亞型，HPV6型和HPV11型；九價疫苗除了含有HPV6、HPV11、HPV18型以外，還含有其他5種可以預防子宮頸癌的HPV高危亞型，即HPV31、HPV33、HPV45、HPV52、HPV58型，可以預防91%左右的子宮頸癌。 如果接種二價或者四價、九價疫苗，還有30%的子宮頸癌可能由其他型別HPV引起，也還有接近大約10%的子宮頸癌由其他HPV高危型別而引起。 另外，有研究表明有6%或者10%的子宮頸鱗癌和20%以上的子宮頸腺癌檢測HPV為陰性，可能與HPV感染無關，所以不能說接種HPV疫苗就不會得子宮頸癌。