半月板損傷的藥物治療主要是控制癥狀的藥物、改善病情的藥物和軟骨保護劑。控制癥狀的藥物又分為口服劑、注射劑和局部外用藥物，口服藥物最常使用的是非甾體類消炎鎮痛藥物，具有止痛消炎的作用，但是要注意胃腸道反應。 注射藥物有透明質酸鈉類藥物，適用于慢性退變性的半月板損傷患者，因為這類患者或多或少都并發有骨性關節炎，對減輕關節疼痛，增加關節活動度，保護軟骨更有效。局部外用藥物也有非甾體類藥物凝膠，可以減輕關節的疼痛，不良反應小。 對于慢性退變性半月板損傷的患者，大多合并有骨關節炎，都是因為退變引起，可以使用氨基葡萄糖類、雙醋瑞因類、硫酸軟骨素。氨基葡萄糖類和硫酸軟骨素類可以改善關節軟骨代謝，提高關節軟骨修復能力，保護損傷關節軟骨，同時能夠緩解癥狀，改善關節功能。 雙醋瑞因是白細胞介素-1的抑制劑，可以抑制軟骨降解，促進軟骨的合成。當然還有中藥湯劑、中成藥，也起到補益肝腎、通經活絡的作用。