抗血栓的藥物總體可分為抗凝藥物、抗血小板藥物、溶栓藥物。抗凝藥物從種類上而言，首先有早期的普通肝素和經典的口服藥物華法林，其次有低分子肝素，使用后無需進行監測，然后有新型口服抗凝藥中為代表的利伐沙班等。抗血小板藥物主要包括拜阿司匹靈、波立維、貝前列素鈉片等。抗凝、抗血栓和抗血小板存在區別，在預防靜脈血栓時常常使用抗凝藥物，預防動脈血栓時，常使用抗血小板藥物。一旦診斷血栓，無論是動脈血栓還是靜脈血栓，往往需要使用抗凝藥物。另外，溶栓藥物，如尿激素、鏈激素，尿激酶的抗栓效果可能比抗凝藥更快，但出血風險較大，使用后往往需要在醫院由血管外科醫生監測，通過下腔靜脈濾器、置管溶栓，增加溶栓效果，降低溶栓出血的風險。此外，還有一類抗血栓的輔助用藥，如川芎嗪等。