乳腺癌化療的并發癥很多，因為化療藥物作用到不同臟器，有不同并發癥。我們常見的是肝臟損傷，肝功能轉氨酶增高，影響食欲，比如惡心、嘔吐；其次最常見就是胃腸道反應，如惡心、嘔吐、腹瀉等并發癥；還有對皮膚的毒副反應，比如常見手足綜合征，即手和腳的脫皮，甚至嚴重時有潰瘍和指甲出血，會有水腫、破潰等并發癥；還有神經毒性，比如手指和腳趾等末梢部位的麻木、疼痛；還有血液毒性，常見的是白細胞下降、血小板下降、貧血等血液毒性，尤其白細胞下降會造成感染發生，會有發熱，還有各種細菌、其它微生物感染發生；另外，對腎臟毒性，比如腎BUN增高、肌酐增高而造成排尿困難，都是乳腺癌化療的并發癥；其它還可以造成皮膚過敏，比如皮疹、瘙癢、蕁麻疹等反應。