大部分腦部骨瘤均為良性疾病，稱為顱骨骨瘤，可分為上方的顱骨蓋骨瘤及顱底骨瘤。顱蓋骨骨瘤可在上方可摸到突起，質地較硬，此時可影響美觀，但極少數骨瘤發生惡變。若患者對此類骨瘤有心理障礙或影響美觀，一般建議手術切除腦部良性腫瘤，切除后一般可達到臨床治愈。但還有部分患者的顱骨骨瘤長在顱底，有時在骨孔旁可產生相應功能障礙，如長到視神經旁可引起視神經管縮小，此時可能亦需進行手術。大部分患者的顱骨骨瘤均生長在額部、頂部，突起一塊且觸摸感較硬。此類患者的手術亦根據侵襲范圍和大小考慮做局麻或全麻手術，總體效果較為滿意。