下肢深靜脈血栓最嚴重的并發癥，即肺栓塞。深靜脈血栓一般情況下穩定，早期盡量讓患者制動，減少活動。如出現血栓脫落導致并發癥，最主要出現呼吸的改變，呼吸急促、胸悶，嚴重者出現窒息死亡。另外一個常見的并發癥是下肢深靜脈血栓形成后綜合征，是由于血栓形成后對瓣膜造成損害，下肢的反流始終存在，始終處于腫脹狀態，甚至會在瓣膜中夾雜少許血栓，機化的血栓始終存在。兩個大的并發癥中，比較少見或罕見的并發癥是肺栓塞，其后果極其嚴重；比較常見的并發癥發生率非常高的是下肢腫脹，是下肢深靜脈血栓形成后綜合征的表現。