肝囊腫的檢查首選是B超，即平時的彩超，彩超作為無創、方便且快捷的方法，是檢查肝囊腫的首選方式。如果需要做手術，或者為了進一步地鑒別肝囊腫的性質，還可以選擇CT、磁共振來明確，檢查是不是合并腫瘤性病變等情況。對于特別疑難的病例，CT和磁共振都不能鑒別病變性質，可以考慮腹腔鏡探查來明確病變性質。彩超診斷肝囊腫的準確率比較高，因為肝臟是實體性器官，而且離腹壁比較近，沒有受到氣體干擾，所以診斷率能達到90%以上。彩超主要對于液體、肝囊腫的壁及肝囊腫內是否有寄生蟲，以及肝囊腫內是否合并感染、出血等問題，能夠達到相當好的效果。