肝門膽管癌晚期是按照Bismuth-Corlette分型，晚期屬于Ⅲ、Ⅳ期以上的這種患者。晚期很多患者其實已經失去了手術機會，生存率是明顯下降。手術的方式、分型、還有血管受侵犯的程度、有無淋巴結轉移、手術當中出血量還有癌腫的病理分化程度，以及進展期肝門部膽管癌患者的預后等，具有密切的相關性。如手術的方式分為根治性的切除，R0切除，還有姑息性的切除，姑息性的切除分為R1切除和R2切除。R1切除是指肉眼看不到癌細胞，但是在顯微鏡下可以看到癌細胞。R2切除就是大部分腫瘤切除，但是肉眼可以看到在殘存的斷面、手術面可以看到癌細胞。肝門部膽管癌晚期，如果根治性的切除，平均生存時間據統計約為3年。但是姑息性的切除平均生存時間約為1-2年。引流保守治療即無法做手術的患者，治療平均生存時間就是6-12個月，所以手術比保守治療效果好。