蛛網膜囊腫在CT上表現為一個較大的圓形低信號占位病變。對于蛛網膜囊腫而言，CT不是最好的檢查方法，但較多蛛網膜囊腫通過CT檢查發現。因為蛛網膜囊腫引起癥狀的可能性較小，大部分蛛網膜囊腫均是因為頭部外傷之后做CT才被發現。 大部分蛛網膜囊腫發生在顳葉，CT檢查時可觀察到左側或右側顳葉，甚至兩側有黑色圓形或橢圓形病灶。此時可進行磁共振檢查，是診斷蛛網膜囊腫的金標準。通過CT發現，最后經過磁共振證實，是確診蛛網膜囊腫最好的方法。 有些患蛛網膜囊腫的病人受外傷后會引起出血，CT可能會有高信號的表現。總體而言，低信號病灶是蛛網膜囊腫典型的CT表現。