出現肌間靜脈血栓以后，在局部會產生無菌性炎癥，這種炎癥會刺激靜脈內的神經末梢，造成疼痛。肌間靜脈血栓的發生范圍逐漸擴大后，疼痛可能會加重，彩超掃描時可能會發現肌間靜脈血栓的范圍較大。這時如果用手擠壓患者的小腿，疼痛會明顯加劇，足踝向上勾時，也會由于張力升高，造成患者疼痛加劇。肌間靜脈血栓雖然面積不大，但危害較大。肌間靜脈血栓較小，如果擠壓過多以后會脫落，造成肺栓塞，如果是全肢型的血栓，下肢腫脹，這種血栓脫落的風險較小，而肌間靜脈血栓脫落的風險較大。