理論上機體各個器官和部位都可能產生囊腫，比如頭部可以產生囊腫，肝部、腎臟以及女性卵巢等部位都可能產生囊腫，不同部位的囊腫有不同的處理辦法。大部分囊腫是良性病變，如果局部有壓迫癥狀，或者囊腫增大很明顯才需要手術，單純的一個小囊腫，無論在哪個器官多半都不需要手術治療。女性常見的囊腫是卵巢囊腫和宮頸囊腫，宮頸囊腫也稱為宮頸納氏囊腫，是慢性宮頸炎的表現。首先要檢查宮頸TCT和HPV，以除外宮頸癌前病變甚至宮頸癌。除外嚴重情況之后，宮頸納氏囊腫一般沒有臨床癥狀不需要特殊治療。女性另一種常見的囊腫是卵巢囊腫，卵巢囊腫大部分屬于生理性卵巢囊腫，是卵巢黃體或者濾泡持續存在的表現。一般囊腫直徑<3-4cm，也不需要治療，來1-2次月經之后就會自行消退。一部分卵巢囊腫屬于卵巢腫瘤性疾病，比如卵巢巧克力囊腫、卵巢漿液性囊腺瘤、卵巢粘液性囊腺瘤等，一般需要行手術摘除。