智齒發炎醫生都會給患者開口服的抗生素，還有抗厭氧菌的藥物，如頭孢類的抗生素加上甲硝唑。極個別的患者對頭孢過敏，可以改用其它的藥物，如阿奇霉素類或者克林霉素等。甲硝唑是抗厭氧菌的藥，還可以用第二代的替硝唑和第三代的奧硝唑來替代，但是甲硝唑、替硝唑和奧硝唑都對胃有刺激；如果胃部有疾病，建議配合維生素B6保護，或者不用甲硝唑之類的藥物，否則會引起胃部的不適，患者可能會惡心、嘔吐。如果智齒發炎，一定要去醫院就診拍X線片，檢查方向是否正常，如果方向不正一定要拔除。