種植牙雖然是創傷比較小、比較精細的手術，但畢竟是手術，特別部分比較復雜的種植手術，會產生不良并發癥，比如疼痛、出血、腫脹，但一般通過局部或者全身用藥可以消除。在臨床工作中，特別是牙床條件非常不好的患者，進行上頜竇的外提升、內提升，以及大量的骨移植，會導致患者局部腫脹、疼痛比較嚴重。對于種植牙并發癥的問題，要視患者的具體情況而言。一般不會導致嚴重的并發癥，但當患者的牙床條件比較差，需要進行額外的手術，如上頜竇的內提升、外提升、大量植骨、塊狀植骨以及神經移植，此時可能會導致上述并發癥。特別是當下頜牙床萎縮吸收比較嚴重，距離下頜神經管比較近時，在種植手術中就要非常小心，因為距離神經比較近，易損傷到神經，進而容易導致出現患者麻木不適感。