牙髓炎根管治療其實沒有副作用，可能會有一定風險。因為在根管治療過程中，如果根管非常復雜或者細小、鈣化、彎曲，在使用機械預備的時候，器械可能會折斷，可能會分離，卡在根管里面取不出來；還有根管不能繼續通下去，即根管擴不通，還有可能遺漏變異根管或者復雜根管。隨著顯微鏡和超聲的應用，這些風險也會大大降低，比如在顯微根管下做根管治療，根管會看的比較清楚，遺漏根管可能性也會降低；根管治療非常復雜，通過常規根管治療沒有辦法解決，這時候可以進行顯微根尖手術，盡量保證患牙保存下來。