微創拔牙是以最小創傷來拔除患牙，因此痛苦非常小。在拔牙術前首先要進行麻醉，麻醉會選擇無痛麻醉、麻醉儀，以勻速緩慢的速度推注麻藥，患者無明顯疼痛。但是因人而異，部分人會感覺在剛進針的一剎那有痛感，但在推注過程中，隨著麻藥發揮作用，患者痛感慢慢消退。 充分麻醉后在拔牙過程中，動作輕柔避免暴力，患者基本上感覺不到痛苦。微創拔牙雖然是小創傷，但不是零創傷，因此患者術后多少還是會有痛感，因人而異和個人體質有很大關系。