甲狀腺疾病從功能上可以分為甲狀腺功能亢進和甲狀腺功能低下，治療甲亢的常用藥物是甲巰咪唑和丙硫氧嘧啶。治療甲狀腺功能低下的常用藥物是左甲狀腺素鈉或甲狀腺素片，現在更常用左甲狀腺素鈉片。 甲狀腺疾病還包括常見的甲狀腺結節，如果甲狀腺結節是惡性的，首選手術來進行切除。如果是良性的結節且沒有壓迫癥狀，甲狀腺功能正常，一般是定期復查B超和甲狀腺功能，進行隨診，不需要藥物治療。