PET-CT并不適用于所有人。一般來說，PET-CT可用于臨床確認有癌癥，了解有無全身轉移的患者；或治療后評估有無復發轉移；或者臨床高度懷疑有惡性腫瘤存在，由于病變比較隱匿，通過常規CT、MR檢查未發現的患者。 對于一般健康人來說，由于此檢查存在核素，且射線相對量比一般CT大，通常不用于體檢檢查。特別是對射線比較敏感的嬰幼兒、孕婦，不建議進行此項檢查。