服用72小時緊急避孕藥，仍然有可能發生意外妊娠，即便在醫生指導下正確服用，依然有5%的避孕失敗可能性。如應用緊急避孕藥后出現避孕失敗，導致意外妊娠，可能給女性的身心健康帶來極大危害。此外，服用不同類型的緊急避孕藥，可能會產生不同的副作用，如惡心、嘔吐，以及陰道異常出血等，可能給女性帶來較多困擾。所以對于普通女性，從婦科專科醫生的角度，不提倡應用該種緊急避孕方法，來達到避孕目的。一般提倡應用對身體危害性更小的常規避孕方法，如應用口服短效避孕藥，正確服用后可抑制排卵，達到較好的避孕效果。此外也可應用避孕環、宮內節育器等，均可達到長時間避孕的目的，也可使用男用避孕套等方式進行避孕。只有對性生活過程中未采取保護措施，或性生活過程中出現紕漏，如避孕套破裂等情況，才能夠應用緊急避孕藥，來盡量降低妊娠可能性。