難治性癲癇的診斷首先是其定義的問題，狹義來說，是兩種或兩種藥物規范治療仍無效果無法得到較好控制的癲癇，其診斷需依據臨床表現，問清病因，排除假性難治性癲癇后將其診斷清楚，確定為難治性癲癇后，還需查明病因。隨著醫學的發展，實際上有越來越多的難治性癲癇能夠得到有效治療。病因方面，尤其是近幾年發現部分相關難治性癲癇患者是與免疫相關的自身免疫性癲癇，也有自身免疫性腦炎的概念提出，自身免疫性癲癇、自身免疫性帕金森病等概念也提出，都是與免疫相關，部分患者是因腦脊液內能夠檢查到相關抗體，進行免疫治療后能夠得到較好控制。另外有部分顳葉癲癇的問題，較多顳葉癲癇在藥物治療難以控制的情況下，可通過手術治療使癲癇得到較好控制。