耳根疼痛的原因，如下：1、耳部炎癥：如急性外耳道炎、急性中耳炎，都可以引起耳朵疼痛，并且咀嚼時疼痛明顯，同時伴有耳悶、耳鳴、聽力下降，后期也會有膿性分泌物。通常給予抗炎治療、炎癥控制以后，病人的癥狀尤其是疼痛癥狀 ，可以完全好轉；2、咽喉的炎癥：由于咽喉炎癥導致神經反射，引起耳朵疼痛，如急性扁桃體炎、急性咽喉炎，病人都會有耳朵的反射痛；3、舌咽神經痛：由舌咽神經損傷導致的舌咽神經痛，疼痛從一側舌根向耳部放射，有時候可以出現鈍痛、刺痛、切割樣疼痛等；4、莖突過長癥：可以引起病人耳部的放射疼痛，疼痛由一側的扁桃體向耳部放射。所以如果有耳朵疼，一定要到醫院就診，通過耳內鏡檢查、咽喉檢查以及影像學檢查，明確病因后進行治療。