細菌性陰道病不能夠自愈，需用藥治療方可痊愈。如果延期不治療，細菌性陰道病可能會導致子宮內膜炎、盆腔炎性疾病，甚至子宮切除后的殘端感染。如果妊娠期患有細菌性陰道病，與絨毛膜羊膜炎、胎膜早破、早產以及產后的子宮內膜炎等不良妊娠結局都有關系，所以有癥狀的妊娠期患者也要接受藥物治療。細菌性陰道病的復發率比較高，復發以后要選用與第一次治療不同的抗厭氧菌藥物，也可以使用陰道乳酸桿菌恢復和重建陰道的微生態平衡。