男孩陰莖疼的常見原因如下：1、陰莖炎或包皮龜頭炎：炎癥會誘發局部筋膜、包皮感染，外觀紅腫同時伴有壓痛。男孩包皮口或尿道外口有血性或膿性分泌物，同時包皮水腫明顯，甚至有水泡或膿泡形成。該病情出現的原因可能與天氣炎熱、飲水少、活動量大、出汗多而排尿少有關。因此出現上述情況時建議讓男孩多喝水、多排尿，讓尿液沖刷局部，會起到較好的治療作用；2、包皮過長：易滋生局部細菌，誘發局部皮膚或軟組織感染。除讓男孩多喝水、多排尿外，還可以使用紅霉素眼膏均勻涂抹于包皮、尿道外口或陰莖體周圍，起到較好的消炎止痛作用。通常經過1-2天的治療，疼痛、腫脹感覺會逐步消失。在以后的生活中一定要注意多喝水、多排尿，如果男孩反復發生陰莖體感染或包皮龜頭炎，也可以考慮做包皮環切手術；3、異物：該原因較為少見，如家長不注意時男孩向尿道中塞入異物，從而出現陰莖疼痛，但外觀正常。綜上所述對于年齡較小的男孩，需防止尿道存在異物的現象發生。如果較大的男孩陰莖疼痛且局部紅腫，則要考慮感染的可能。