嬰兒鵝口瘡經常發生在不注意衛生或免疫功能低下時的嬰兒。當發現鵝口瘡時在局部可以用2%-4%堿性液如小蘇打，清理口腔，每天清理3-4次。清理口腔之后用制霉菌素甘油進行涂抹局部，如果嚴重的鵝口瘡的患兒還需要口服制霉菌素，甚至輸液此類藥物進行治療。 此外嬰兒還要注意營養，要注意喂養提高嬰兒抵抗力，要補充B族維生素注意平時衛生，嬰兒應用的東西一定要注意消毒，用熱水進行燙，并且放在陽光下進行暴曬比如孩子的奶嘴、口水巾等要及時定期更換。 母乳喂養的嬰兒，母乳喂養時乳頭也要注意及時清洗。另外嬰兒菌群失調也會引起鵝口瘡，要注意補充益生菌治療，同時避免濫用、長期應用抗生素。