治療干眼癥的最佳藥物需要干眼癥的類別來選擇。 淚液分泌不足型干眼癥往往是淚腺或者副淚腺的功能下降，造成淚液的分泌能力下降，可能跟干燥綜合征等免疫疾病有關，可采用對因治療，或采取對癥治療，即補充人工淚液。 蒸發過強型干眼癥與瞼板腺的功能有關，瞼板腺功能失代償以后，造成瞼板腺的油脂分泌物不能夠及時到達眼睛表面，可以應用抗炎藥、瞼板腺的按摩理療等治療方法，治療時間相對較長，而且需要藥物和理療同時進行。 此外，還可以采取瞼板腺的激光治療，激光可以促進瞼板腺的排泄，使療程大大縮短。