CT檢查及磁共振檢查存在不同優勢，二者檢查的重點不同，針對疾病的敏感度也不同，需根據疾病進行相應的分析。頭顱CT通常對腦出血敏感性較高，若患者存在出血，則首選頭顱CT。但若患者懷疑存在腦梗死，則應首選磁共振，因為磁共振對腦梗死的鑒別更清楚、直觀，并且可以準確判斷腦梗死的部位、大小以及體積。此外，在腦梗死急性期通常需進行CT檢查。腦出血與腦梗死的鑒別存在一定的難度，對于懷疑存在腦梗死或腦血管病的患者，應首先進行CT檢查以明確是否存在出血。若排除出血的情況，但存在腦血管性的表現且起病較急，則懷疑為腦梗死，所以有必要在急性期進行CT檢查。