兒童皰疹性口炎多發生于6歲前的兒童，6個月到3歲的嬰幼兒更為多見，會有全身癥狀和局部癥狀。全身癥狀主要是發燒、煩躁、拒絕吃東西，有時候頜下淋巴結也會腫大、壓痛，咽喉部輕度疼痛的前驅癥狀， 7-14天會逐步消失。黏膜的損害，口腔黏膜的任何部位都會發生，出現平浮而不隆起和界限清楚的紅斑，紅斑上會有成簇的小皰。皮膚的損害，在嘴唇、口角、鼻喉等區域，都會出現若干的小皰，如果水皰破潰以后也不會結痂，不會留痕跡、不會留瘢痕。