右腎囊腫一般不會引起腰痛。如果囊腫比較大，或者囊內有出血、感染，也可以引起腰痛。囊腫是膨大的腎小管憩室釋構成，隨著囊液不斷分泌，囊腫會逐漸增大。在增大過程中，可能會影響腎臟形態。腎臟是內臟器官，感受不到局部疼痛。只有腎臟瓣膜受到牽拉或者腎盂受到累及時，病人才會感覺到腎區不舒服或疼痛。囊腫不大時，對腎臟基本上沒有太多牽扯，這時不會有疼痛。隨著囊腫不斷增大，牽拉腎臟包膜，病人會感覺到疼痛不適。另外當囊腫壓迫腎盂時，也會有不舒服的感覺。如果囊腫生長過快，囊內可能會有出血、感染、鈣化結石等，病人會感覺到腰部不舒服或腰痛，而且這種腰痛往往不是銳痛，以鈍痛為主。病人會感覺到腰部脹痛，甚至感覺到腰酸、腰脹、腰麻等。