通常情況下，扁桃體炎對核酸檢測沒有影響。扁桃體炎是因細菌或病毒感染所致，而核酸檢測是通過采取鼻腔黏膜，或咽部黏膜的分泌物，來觀察有無有感染病毒的檢查。由于兩者之間沒有相關性，因此通常不會受到影響。但在臨床上經常存在有假陰性，或假陽性的情況，通常需反復采集標本，并反復檢測，只有檢查結果達到一致的情況下，即可得到確診。扁桃體炎臨床上可分為急性扁桃體炎，及慢性扁桃體炎，急性扁桃體炎常因細菌感染而導致，常見的是乙型溶血性鏈球菌及葡萄球菌。患者可表現為咽痛、咽部不適，以及扁桃體充血、腫脹，甚至出現化膿的情況。治療首選抗生素，如頭孢克肟膠囊。而慢性扁桃體炎通常是因急性扁桃體炎反復發作而導致，對人體的危害是形成病灶，繼而引起全身并發癥，建議患者應及時行扁桃體摘除術。