中耳炎在手術時都是用碘伏進行皮膚消毒、耳道消毒，中耳腔內的消毒都是用碘伏。慢性的中耳炎有專門的治療方法，一般都是由醫生在慢性中耳炎發作時，往往外耳道里面都會有很多膿液，甚至伴隨耵聹，會造成阻塞，此時醫生會幫助清理，把耵聹之類的清理掉，進行吸膿，使膿液能夠順暢引流出來，之后醫生會用抗生素滴耳液，甚至有的抗生素里會加激素，促進更快愈合。 嚴重時甚至還會用全身抗生素，比如口服抗生素、輸液方法，一般很少會用碘伏進行消毒，但分泌物流到外面，用棉簽蘸碘伏清洗也可以，治療中耳炎不需要用碘伏進行消毒。