益生菌本身沒有直接的抗過敏作用，但是有些病人會對不同的食物，產生不同的食物不耐受，產生不同的癥狀。所以從這個層面上來說，益生菌確實能夠達到治療作用。如果有些病人出現了乳糖不耐受，或者是喝完奶以后、吃完甜的食物以后，會出現腹瀉癥狀，這時候可以考慮使用益生菌治療。臨床上常用的益生菌有乳酸桿菌、雙歧桿菌、枯草桿菌，這些益生菌都可以使用。對于有些患者喝酸奶沒有任何不適的臨床癥狀時，也可以通過分次吃，有效攝入酸奶，同樣也可以起到改變腸道內菌群、改變腸道內的微環境，從而達到治療腸道食物不耐受的狀態。特別是一些嬰幼兒，這些情況比較突出，因為嬰幼兒在成長過程中，會逐步接受機體從來沒有攝入過的各種各樣的動物蛋白。所以在攝入動物蛋白的過程中，可能有些小孩會出現食物不耐受，出現便秘、腹瀉、消化不良的癥狀。因此如果出現這些問題時，可以采用上述提到的益生菌進行治療。