生殖器皰疹是由單純皰疹病毒Ⅰ型或Ⅱ型感染引起，單純皰疹Ⅱ型較多見，單純皰疹Ⅰ型通常引起口唇皰疹，也可通過口腔傳染到生殖器，性交時帶毒方的病毒可直接接種于女性宮頸、外陰、肛門和口咽黏膜表面，也可通過生殖器或肛門皮膚黏膜摩擦，出現微小裂隙及損傷，進入易感者皮膚黏膜。此外，母體感染單純皰疹病毒可在子宮內傳播給胎兒，或分娩時經產道傳播給新生兒。 女性通過性接觸傳染的生殖皰疹均長在外陰及肛周，黏膜出現局性紅斑，紅斑上針尖大小水皰，水皰糜爛出現結痂、潰破，伴有輕微癢、疼，女性特殊類型的生殖器皰疹，如皰疹性宮頸炎，表現為黏液膿性宮頸炎，多數患者有膿液或血性陰道分泌物、宮頸充血及脆性增加，出現水皰、糜爛，甚至壞死，若患妊娠期生殖器皰疹，可造成胎兒宮內發育遲緩、流產、早產甚至死亡，初發生殖器皰疹需及早治療，若出現復發性生殖器皰疹，則較難治愈。