引導組織再生術的適應癥主要根據牙槽骨缺損的范圍來判斷，簡單來講，如果是四方形的花盆，只缺了一角可以輕易的把花盆的邊補起來，但是如果缺的邊越多，就越難保持骨頭的穩定，骨頭也比較難長好。所以一壁骨的缺損和二壁骨的缺損是引導組織再生術的適應癥，第三類缺損跟第四類缺損效果較差，成功率較低而手術創傷較大。所以引導組織再生術，一般會選擇在第一類缺損或者第二類缺損的患者中進行，第三類缺損或第四類缺損的患者會慎重考慮。 對于牙周基礎疾病沒有控制的患者，即牙周炎進展期的患者，不適宜進行引導組織再生術。另外，長期服用抗凝藥物或者減少骨質代謝的藥物者，如雙膦酸鹽，也要慎重。如果患者近期需要放化療，這種狀況也不適宜做引導組織再生術。